.: ORİJİNAL ARAŞTIRMA
Türk Popülasyonunda Mitokondriyal DNA Delesyonlarında Yaşlanma ve Sigara Kullanımının Etkisi
The Effects of Aging and Smoking on the Deletions of Mitochondrial DNA in Turkish Population
Turkiye Klinikleri J Med Sci. 2010;30(4):1292-8
doi: 10.5336/medsci.2009-13717
Makale Dili: TR
Tam Metin
ÖZET
Amaç: Çalışmada, Türk populasyonunda, sigara kullanan ve kullanmayan gönüllülerin saç foliküllerindeki 4977 bç ve 7436 bç mtDNA delesyonlarında yaşlanmanın etkisi araştırıldı. Gereç ve Yöntemler: Çalışma için 100 sağlıklı gönüllüden 3-7 adet saç folikül örneği toplandı ve bireyler yaşlarına, sigara kullanım alışkanlıklarına ve sigara tüketim miktarlarına göre gruplara ayrıldı. Toplam DNA izolasyonu, saç foliküllerinden "Qiagen DNA Mini Kit" i kullanılarak yapıldı. 4977 bç ve 7436 bç mtDNA delesyonlarını belirlemek için, bölgeler polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) ile amplifiye edildi, çoğaltılan ürünler %2'lik agaroz jel elektroforezi ile ayrılarak etidyum bromürle boyandı ve ultraviyole ışık altında görünür hale getirilerek fotoğraflandı. Bulgular: Sonuçlarımız 4977 bç ve 7436 bç mtDNA delesyon frekanslarının yaşlanma ile arttığını göstermiştir (sırasıyla, p=0.003 ve p=0.005). 4977 bç mtDNA delesyonu rölatif risk değerinin 65 üzeri yaş grubunda, 35 altı yaş grubuna göre 5.11 kat daha fazla olduğu (p= 0.002) belirlenirken, 7436 bç mtDNA delesyonuna 35 yaş altında ve 35-65 yaş grupları arasında hiç rastlanmamıştır. 4977 bç mtDNA delesyonu ile sigara kullanımı ve sigara tüketim miktarı arasında anlamlı ilişki bulunmuş (p<0.01) ancak aynı ilişki 7436 bç mtDNA delesyonunda belirlenememiştir. Ancak 7436 bç delesyon belirlenen üç birey de ağır sigara içiciler ve 65 yaş üzeri grupta yer almaktadır. Sonuç: 4977 bç ve 7436 bç mtDNA delesyon frekansları ile yaşlanma arasında istatistiksel olarak anlamlı pozitif korelasyon tespit edilmiş, ayrıca 4977 bç mtDNA delesyonunun sigara kullanımı ve sigara tüketim düzeyi ile artış gösterdiği belirlenmiştir.
Anahtar Kelimeler: DNA, mitokondrial; gen delesyonu; sigara içme; yaşlanma; kıl folikülü
Amaç: Çalışmada, Türk populasyonunda, sigara kullanan ve kullanmayan gönüllülerin saç foliküllerindeki 4977 bç ve 7436 bç mtDNA delesyonlarında yaşlanmanın etkisi araştırıldı. Gereç ve Yöntemler: Çalışma için 100 sağlıklı gönüllüden 3-7 adet saç folikül örneği toplandı ve bireyler yaşlarına, sigara kullanım alışkanlıklarına ve sigara tüketim miktarlarına göre gruplara ayrıldı. Toplam DNA izolasyonu, saç foliküllerinden "Qiagen DNA Mini Kit" i kullanılarak yapıldı. 4977 bç ve 7436 bç mtDNA delesyonlarını belirlemek için, bölgeler polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) ile amplifiye edildi, çoğaltılan ürünler %2'lik agaroz jel elektroforezi ile ayrılarak etidyum bromürle boyandı ve ultraviyole ışık altında görünür hale getirilerek fotoğraflandı. Bulgular: Sonuçlarımız 4977 bç ve 7436 bç mtDNA delesyon frekanslarının yaşlanma ile arttığını göstermiştir (sırasıyla, p=0.003 ve p=0.005). 4977 bç mtDNA delesyonu rölatif risk değerinin 65 üzeri yaş grubunda, 35 altı yaş grubuna göre 5.11 kat daha fazla olduğu (p= 0.002) belirlenirken, 7436 bç mtDNA delesyonuna 35 yaş altında ve 35-65 yaş grupları arasında hiç rastlanmamıştır. 4977 bç mtDNA delesyonu ile sigara kullanımı ve sigara tüketim miktarı arasında anlamlı ilişki bulunmuş (p<0.01) ancak aynı ilişki 7436 bç mtDNA delesyonunda belirlenememiştir. Ancak 7436 bç delesyon belirlenen üç birey de ağır sigara içiciler ve 65 yaş üzeri grupta yer almaktadır. Sonuç: 4977 bç ve 7436 bç mtDNA delesyon frekansları ile yaşlanma arasında istatistiksel olarak anlamlı pozitif korelasyon tespit edilmiş, ayrıca 4977 bç mtDNA delesyonunun sigara kullanımı ve sigara tüketim düzeyi ile artış gösterdiği belirlenmiştir.
Anahtar Kelimeler: DNA, mitokondrial; gen delesyonu; sigara içme; yaşlanma; kıl folikülü
ABSTRACT
Objective: We studied the effect of aging on 4977 bp and 7436 bp mtDNA deletions in among the hair follicles of smoker and non-smoker volunteers inTurkish population. Material and Methods: Three to seven hair follicles were collected from 100 healthy volunteers for the study and subjects were grouped according to age, smoking habits and the amount of cigarettes consumed. "Qiagen DNA Mini Kit" was used for the isolation of total DNA from hair follicles. The 4977 bp and 7436 bp gene regions were amplified with polymerase chain reaction (PCR) for the determination of mtDNA deletions. Amplified products were photographed under ultraviolet light after 2% agarose gel electrophoresis and staining with ethidium bromide. Results: The frequencies of 4977 bp and 7436 bp mtDNA deletions increased with aging (p=0.003 and p=0.005, respectively). The relative risk of 4977 bp mtDNA deletion increased 5.11 fold among age group above 65 compared to the group below 35 (p=0.002). The 7436 bp mtDNA deletion was not observed among subjects below 65 years of age. There was a significant relation between the 4977 bp mtDNA deletions and smoking and the amount of cigarettes consumed (p<0.01). The same relation could not be demonstrated for 7436 bp mtDNA deletions, however, three subjects who had 7436 bp deletions were heavy smokers and older than 65 years of age. Conclusion: There was a statistically significant positive correlation between the frequencies of 4977 bp ve 7436 bp mtDNA deletions and aging. The 4977 bp mtDNA deletions increased with smoking and the amount of cigarettes consumed.
Keywords: DNA, mitochondrial; gene deletion; smoking; aging; hair follicle
Objective: We studied the effect of aging on 4977 bp and 7436 bp mtDNA deletions in among the hair follicles of smoker and non-smoker volunteers inTurkish population. Material and Methods: Three to seven hair follicles were collected from 100 healthy volunteers for the study and subjects were grouped according to age, smoking habits and the amount of cigarettes consumed. "Qiagen DNA Mini Kit" was used for the isolation of total DNA from hair follicles. The 4977 bp and 7436 bp gene regions were amplified with polymerase chain reaction (PCR) for the determination of mtDNA deletions. Amplified products were photographed under ultraviolet light after 2% agarose gel electrophoresis and staining with ethidium bromide. Results: The frequencies of 4977 bp and 7436 bp mtDNA deletions increased with aging (p=0.003 and p=0.005, respectively). The relative risk of 4977 bp mtDNA deletion increased 5.11 fold among age group above 65 compared to the group below 35 (p=0.002). The 7436 bp mtDNA deletion was not observed among subjects below 65 years of age. There was a significant relation between the 4977 bp mtDNA deletions and smoking and the amount of cigarettes consumed (p<0.01). The same relation could not be demonstrated for 7436 bp mtDNA deletions, however, three subjects who had 7436 bp deletions were heavy smokers and older than 65 years of age. Conclusion: There was a statistically significant positive correlation between the frequencies of 4977 bp ve 7436 bp mtDNA deletions and aging. The 4977 bp mtDNA deletions increased with smoking and the amount of cigarettes consumed.
Keywords: DNA, mitochondrial; gene deletion; smoking; aging; hair follicle
.: İşlem Listesi